埃及陸龜曾分布在埃及及利比亞，但在埃及的棲息地已完全被破壞，它們已從當地滅絕。在利比亞的，的黎波里塔尼亞和昔蘭尼加，仍有兩個群落存在。

　　由于未確認的特征，建議的亞屬Pseudotestudo并未有效。另有建議將埃及陸龜與緣翹陸龜組成Chersus屬，因它們的共同祖先是希臘陸龜。前兩者的DNA序列近似，比與希臘陸龜更為相似。從生物地理學來看，這可能是由于分布跨越地中海或是因趨同演化所致。

　　內蓋夫的亞群因分散而成為獨立的納吉夫陸龜。但是它們并不獨特，與埃及陸龜在埃及滅絕的群落相符。納吉夫陸龜是局部地區適應的形態，而外表不同。它們有可能是埃及陸龜的亞種。由于基因流已經停止，它們的保育方法須有不同的處理。

　　埃及陸龜，Testudo kleinmanni，又名克萊馬尼陸龜，包括了納吉夫陸龜，是一種處于極危的龜。它們雖然稱為埃及陸龜，但已從埃及滅絕，在全球滅絕只是時間的問題，埃及陸龜，也屬于地中海陸龜家族成員之一，世界自然保護聯盟將埃及陸龜列為極危，也可以算是家族中最脆弱，飼養難度也最高的種類。在環境或飲食上的些微改變都可能造成受迫死亡。對病菌抵抗力更差，因此最好不要與其它龜類混養。