斑葉堇菜為低矮無莖的多年生小草本。葉片通常呈圓形，上面綠色并沿葉脈有明顯的白色斑狀條帶，下面常帶紫紅色，但有時呈綠色，在自然生長狀態下極易識別。但在果期或干標本上，葉下面的紫紅色常退色變為綠色。

　　斑葉堇菜的花紅紫色或暗紫色，下部通常色較淡，長1.2-2.2厘米;花梗長短不等，超出于葉或較葉稍短，通常帶紫紅色，有短毛或近無毛，在中部有2枚線形的小苞片;萼片通常帶紫色，長圓狀披針形或卵狀披針形，長5-6毫米，先端尖，具狹膜質邊緣并被緣毛，具3脈，基部附屬物較短，長1-1.5毫米，末端截形或疏生淺齒，上面被粗短毛或無毛。

　　花瓣倒卵形，長7-14毫米，側方花瓣里面基部有須毛，下方花瓣基部白色并有堇色條紋，連距長1.2-2.2厘米;距筒狀，長3-8毫米，粗或較細，末端鈍，直或稍向上彎;雄蕊的花藥及藥隔頂端附屬物均各長約2毫米，下方2枚雄蕊的距細而長，長可達4毫米，粗約0.3毫米。子房近球形，通常有粗短毛，或近無毛，花柱棍棒狀，基部稍膝曲，向上漸增粗，柱頭兩側及后方明顯增厚成直伸的緣邊，前方有明顯的短喙，喙端具向上開口的柱頭孔。